虽然品牌授权与特许经营在组织形式上非常相似，但从品牌授权方和被授权方、特许经营许可方与被许可方的本质关系上看，二者又有着较大的区别。品牌授权的操作更灵活，更容易形成授权双方的合作关系。
（1）“特”的不同。
1）授权的内容。
特许经营的授权内容一般有两种：商品销售特许经营和经营模式特许经营。授权给经营人的是产品或服务，甚至包括整套经营模式。例如可口可乐、固特异轮胎属于商品销售特许经营，WENDY、MAACO、UNIGLOBE和GNC公司采用经营模式特许经营。
品牌授权是授权方将自己的品牌授权给经营商，由经营商按约定的条件开发、生产、销售授权品牌的产品。例如日本城百货有限公司获得迪士尼公司的授权生产销售米奇、小熊维尼品牌形象的文具用品。
品牌授权强调授权方和被授权方的纽带是品牌，而特许经营许可方和被许可方的纽带则是一种产品或服务以及一套经营系统。
2）品牌的开发。
品牌是特许经营系统中最重要的资产，在顾客眼中，品牌就是公司的声誉——他们所期望得到的感受和体验。品牌认知是特许经营人购买特许经营权时希望拥有的一个部分。品牌的成名并非与生俱来，几乎所有的特许经营授权人都是首先确立在当地的品牌认知（可能只是临近的各街区），然后逐步确立地区或全国范围内的地位。特许经营先需要一个原始模型的企业，或者说是母公司，再进行复制开发。在美国，有个名字叫熊猫快餐的中式连锁餐饮企业。它已经在包括美国在内的世界各地开了2000多家餐厅，在实力上不亚于肯德基和麦当劳。它的创始人名叫程正昌。熊猫快餐有两道招牌菜，那就是陈皮鸡和宫保鸡丁，是创始人倾力开发的招牌产品。
品牌是品牌授权业最重要的资产，但品牌的创立则完全不同。品牌授权人一般会根据广为流传的传统故事结合现代流行元素开发品牌形象，如英国女作家罗琳创作的《哈利·波特》，首先是系列书在全球热卖，改拍成电影的第一集与第二集也在全球市场告捷，哈利·波特的人气也急剧增加，为作者、书商、电影商及相关授权商品生产者带来了连绵不断的市场商机。品牌授权业推广的重点在于不断培育品牌形象，提醒消费者这些品牌的存在，维持品牌的知名度，像米老鼠、加菲猫等形象已经成为人们生活的一部分。品牌授权商则不需要有品牌商品的生产制造实体。
（2）“许”的区别。
1）运营的基础不同。
特许经营的基础是商品或服务的标准化，它的营业系统提供的是从创建公司之日起的几乎所有的经营细节计划，诸如特许经营人如何管理建筑物的建设、订购适当的设备，甚至包括如何竖立标牌。所有健全的特许经营系统都努力创造最高程度的和谐统一，在世界上任何一个地方的所有特许经营店都要看上去一样、感觉一样。特许经营强调严格规范化的管理原则，要求加盟店的经营管理模式与特许人相同，而且产品和服务的质量标准也必须统一。每一份Biggie公司的油煎食品都是一致的，每一间Marriott Court Yards的旅馆房间都有一个午餐柜、一张长沙发和几部统一的电话。
品牌授权的基础是开发品牌形象并维持该品牌形象的知名度和地位，凭借消费者对该品牌形象的喜爱而产生对其代表产品的购买欲望去授权制造商使用该品牌开发系列商品。品牌授权方对被授权方的管理主要是授权商品的品质控制，不能让低劣的商品影响品牌的形象。另外，对被授权方可以生产销售的授权的商品种类、授权商品的销售区域也会在合同中确定清楚。例如，广州有茶特许经营模式并不是仅仅授予品牌使用权，而是介入门店经营，为特许经营方提供一站式的服务支持。在开业前，加盟商主要负责门店的选址，有茶团队辅助筹备。开业后，加盟商只需维护门店日常运营即可，有茶则帮助建立完善的供应链系统、运营培训系统、市场营销系统、信息数字化系统、会员体系、财务系统等服务支持。
为了保证门店的品牌形象统一，有茶还成立了一家工程公司和设计公司，提供精确的门店施工图样，加盟商可按照图样找人施工，也可选择有茶的工程服务。门店设施竣工后，加盟商提供第三方监理报告，确保门店形象的一致性。
相对于特许经营，品牌授权给予被授权方更大的自由度，适应的行业较广，更容易达成品牌授权方和被授权方之间的优势互补。授权商专注于品牌经营，无须投资生产线、人员等要素就可以获得丰富的商品种类；被授权商专注于生产和分销，无须投资大量的广告用于品牌建设就可以获得知名品牌带来的优势。
特许经营的成功在于一致性，即授权人和经营人都在用同样的模式从事同样产品或服务的经营活动。
品牌授权的特色则是在统一品牌下授权人经营的产品或服务的不一致性，不同的授权人拥有不同的授权商品类别。例如，迪士尼公司在全球拥有4000多家品牌授权企业，其产品包含从最普通的圆珠笔到价值2万美元一块的手表。正因为这种不一致性，被授权方之间产生冲突的可能性和协调的难度较小，而且可以相互补充。通过同一品牌下多种授权商品在市场上的密集渗透，易于形成消费者族群效应。
2）拓展方式的区别。
特许经营授权人通常为经营人划出一定的区域，在这一区域不允许公司总部或其他特许经营人开办其他相关的经营店。一个好的特许经营系统通过不断地在适当的区域建立适量的经营店，能确保品牌认知，进行品牌渗透，实现业务拓展。
品牌授权业务拓展的第一步是品牌拓展，不断地拓展品牌的知名度和品牌影响的区域，比如哆啦A梦首先在日本流行，再风行我国港台地区，又进入我国内地。第二步是不断地通过授权进行商品种类的开发。授权商品的开发是品牌授权业的核心环节，一般是根据品牌的特点和适合目标消费群体开发相关系列产品，通过品牌形象的带动和丰富的商品种类形成消费者族群效应，创造良好的业绩。授权商品通常种类丰富，如多莱宝公司的卡通授权商品项目就包括玩具、文具、衣服、鞋、书包、袋类、钟表、陶瓷杯、水晶杯、家用精品等，主要以5～20岁的青少年及家长为消费对象。
总之，特许经营与品牌经营有着密切的内在联系。首先，从内容实质来看，特许经营是将注册商标、企业标志、专有技术等经营资源进行许可使用的一种商业模式。这些经营资源都属于无形资产的范畴，其实质就是品牌。其次，从表现形式来看，被特许人（加盟者）须按照特许经营合同规定，在统一的经营模式下开展经营，包括经营理念的统一、店面形象的统一、操作流程的统一和产品服务的统一。这种统一化规则与品牌的“一个声音、一个形象、一个标准”的运营规则完全一致。诚信是特许经营品牌营销的根本。
