组织根据功能在横向上可以分为不同的部门来实现组织目标。管理信息系统为了满足各组织部门的信息需求，专门设计了相应的具有专门功能的管理信息系统。对最常见的制造企业来说，管理信息系统在组织横向上可以分为销售管理信息系统、生产管理信息系统、采购管理信息系统、财务管理信息系统、人力资源管理信息系统等。
（1）销售管理信息系统
销售管理信息系统通常包括产品的销售、推销及售后服务的全部活动，是一个用来辅助企业销售活动、销售管理和销售决策的工具。管理销售信息系统的主要功能有管理销售信息、控制销售活动、处理销售业务、确定销售方针、分析销售环境及效果、规划销售策略、制作报表、制订预算等。
（2）生产管理信息系统
生产管理信息系统的主要功能是满足组织生产部门的各项活动，包括产品的设计与制造、生产设备计划、生产工人录用与培训、质量控制等。通过生产管理信息系统，管理者能够随时了解生产情况、库存情况，自动生成生产配料单，跟踪整个生产过程，科学管理生产物料，同时还可以帮助企业管理者有效控制生产成本，及时了解产品产量及库存的业务细节，发现存在的问题，避免库存积压，做出快速的市场反应。
（3）采购管理信息系统
采购管理信息系统是综合采购申请、采购订货、进料检验、仓库收料、采购退货、购货发票处理、供应商管理、价格及供货信息管理、订单管理及质量检验管理等功能的管理系统，对采购物流和资金流的全部过程进行有效的双向控制和跟踪，实现完善的企业物资供应信息管理。
（4）财务管理信息系统
财务管理信息系统分为企业财务和决策两个层次。企业财务以总账系统为核心，包括总账、应收应付、现金管理、项目管理、工资管理和固定资产管理等模块，为企业的会计核算和财务管理工作提供了全面、详细的解决方案。决策功能是利用信息技术，结合财务管理方法、管理理论，以计算机及网络为工具，建立各种预测、决策、预算与控制及分析模型，如财务预算、营运资金管理和控制、投资决策分析、筹资决策分析、销售和利润预测与管理、成本计算和控制、财务分析等。
（5）人力资源管理信息系统
人力资源管理信息系统是管理信息系统在人力资源管理部门的应用。人力资源部门借助人力资源管理系统，可实施电子化人力资源管理，如招聘、培训、使用、考核、评价、激励、调整等。
