一般而言，由于创新过程本身的不确定性，创新通常会面临如下风险：
1.开发风险。
创新过程是投入创新和研发资源以换取不稳定回报的过程。研发投资的成效，既取决于研发人员的能力和创造力，还取决于研发项目本身的可行性以及研发资金的保障。因此，研发投入不一定总能成功，产生预期的技术成果与产品。例如，一向以创新引领潮流而著称的英特尔公司开发Anypoint的尝试，最后不得不以失败告终。
2.市场风险。
创新带来的市场风险包括市场接受能力的不确定性和市场接受时间的不确定性两个方面。一方面，新产品和新服务在推出后，客户可能因对此不熟悉而持怀疑态度甚至作出错误的判断，使得企业对市场能否接受以及能接受多少难以进行准确估计。同时，新产品、新服务的价格和市场定位可能不够准确或者产品性能与品质缺乏稳定性，从而导致消费者拒绝接受新产品和新服务。这些不确定因素构成了所谓的市场接受风险。另一方面，新产品和新服务诱导出有效需求的时间不好掌控，如时间拖得过长将导致企业开发新产品的资金难以收回，此即市场时滞风险。总而言之，创新性技术和产品被市场认可的程度和速度，以及相应的投资回报是非常不确定的，对此，创新投入者也必须作好事前评估和心理准备。20 世纪曾经轰动一时的“铱星计划”，在经历了 12 年的研发后，最终没有获得市场青睐而失败了。从技术创新的角度来看，铱星计划无疑是移动通信系统的一次重大的技术创新，但即使像摩托罗拉公司这种跨国巨人在高技术带来的高风险面前也显得那样无能为力。因为任何创新产品最终都要接受市场的检验。
3.机制转化风险。
制度和机制创新是企业创新的重要组成部分。创新当然会有破有立，破旧立新。这一过程可能因触动部分人的利益而遭反对，也可能因不被大家理解而遭抵制。更重要的是，在旧的制度废除以后，新的体制未必能立即奏效，或者说未必能产生预期的效果，从而导致企业运营管理方面的紊乱。
4.决策风险。
创新，顾名思义，是一个创造新事物的过程，同时也是关乎企业发展战略的重要决策。由于决策者在制定创新战略时，遇到的是新问题，面对的是新环境，没有可供利用的现成方案，因此创新决策具有很大的不确定性。由此可见，创新战略决策如果处理不慎，可能会带来很大风险。
