从广义上来讲，农产品物流组织形式多种多样，主要有三类：
以独立形式存在的社会化农产品物流组织，主要包括传统的农产品储运企业、农产品第三方物流企业和第四方物流企业；
以非独立形式存在的非社会化农产品物流组织，主要有农产品生产、流通和加工企业内部的农产品物流部门；
不同企业之间形成的农产品物流中间性组织，主要有农产品物流联盟组织、农产品虚拟物流组织。农产品物流组织形式与社会生产力发展水平有着直接关系，在一定的经济和技术发展水平的条件下，农产品物流组织常常以多种形式共存，并以某种或某几种组织形式为主。
在农业生产和流通水平较低的情况下，“商物合流”是农产品流通的主导形式，这时农产品物流组织常常以个体私营运输业者、非社会化的企业内部组织为主。
随着农业生产和流通水平的不断提高，农产品的生产、流通、加工等领域的社会分工不断加剧，农产品的“商物分流”现象将日渐突出，专业化的农产品物流组织将会越来越多，社会化的农产品第三方物流企业逐渐成为主导形式。
在信息网络技术较为发达，合作竞争的理念被企业广泛接受的情况下，以合作为基础，以物流信息化和网络化为本质特征的新型农产品物流中间性组织将获得较快发展 。
